Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms