Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zscan5bB2RTN3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms