Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf518bB2RRE4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms