Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms