Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BC035947B2RQY6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BC035947B2RQY6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035947B2RQY6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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