Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp40B1B1D3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms