Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms