Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms