Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M5A7VMS3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms