Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3173A6NAS3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3173A6NAS3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms