Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf2A3KGV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf2A3KGV1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms