Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf39A2RT81 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms