Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms