Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb1A2AQ07 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms