Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1A2ANU3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms