Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms