Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms