Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb4A2A863 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms