Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms