Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nlrp1bA1Z198 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1bA1Z198 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms