Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms