Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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