Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt27Q9Z320 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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