Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Hdac5Q9Z2V6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms