Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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