Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf3Q9Z2L7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Crlf3Q9Z2L7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Crlf3Q9Z2L7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Crlf3Q9Z2L7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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