Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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