Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms