Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms