Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms