Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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