Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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