Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn3Q9Z0G9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn3Q9Z0G9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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