Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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AireQ9Z0E3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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