Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katna1Q9WV86 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms