Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp18Q9WTV6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp18Q9WTV6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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