Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms