Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hic1Q9R1Y5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hic1Q9R1Y5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms