Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NrkQ9R0G8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NrkQ9R0G8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms