Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms