Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms