Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc3Q9R0B6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc3Q9R0B6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms