Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Col4a4Q9QZR9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a4Q9QZR9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms