Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp21Q9QZL6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Usp21Q9QZL6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp21Q9QZL6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms