Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Copg1Q9QZE5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Copg1Q9QZE5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms