Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms