Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ercc4Q9QZD4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ercc4Q9QZD4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms