Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms