Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms