Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms